Вирішена найбільша проблема біології

Вчені розробили нову систему штучного інтелекту DeepMind AlphaFold, здатну передбачати тривимірну структуру білка. Проблема фолдинга (згортання) білків була визнана біологами усього світу як одна з найбільших проблем сучасної науки, і над її вирішенням дослідники билися близько півстоліття.

Вчені розробили нову систему штучного інтелекту DeepMind AlphaFold, здатну передбачати тривимірну структуру білка. Проблема фолдинга (згортання) білків була визнана біологами усього світу як одна з найбільших проблем сучасної науки, і над її вирішенням дослідники билися близько півстоліття.

• Проект Zoonomia - найбільше порівняння генома ссавців

Результати оцінки Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP), що проводиться науковим співтовариством з 1994 року, показали, що AlphaFold забезпечує безпрецедентну точність в прогнозуванні структури білка. Учасники випробувань CASP повинні представити систему, здатну передбачити, як згорнеться білок, по послідовності амінокислот, кожна з яких має певні хімічними властивостями (наприклад, полярності і гідрофобності). При цьому результат прогнозу порівнюється з тривимірною структурою, виявленої експериментальним шляхом.

Для тестування використовуються тільки ті білки, чиє згортання було вивчено лише недавно, а в деяких випадках ще не вивчено. В останньому варіанті потрібно чекати, поки тривимірна структура не буде отримана для порівняння.

Середня оцінка для AlphaFold склала 92,4 за метрикою Global Distance Test (GDT). При цьому оцінка 90 GDT вважається конкурентоспроможною серед результатів, отриманих експериментально. Це означає, що штучний інтелект здатний у багатьох випадках прораховувати тривимірну структуру білків точніше, ніж з використанням ряду лабораторних методів.

Тривимірна структура білків тісно пов'язана з їх функціями. Однак для кожної амінокислотноїпослідовності теоретично існує астрономічне число способів згортання, але тільки кілька можуть реалізовуватися і відігравати важливу роль для організму.

Посилання